La primera parroquia de Pantin se creó a raíz de la visita al pueblo de Saint Germain (hacia 378-448), obispo de Auxerre. La primera iglesia real data probablemente del siglo XII, pero en 1649 un decreto real la declaró demasiado dañada para permitir el culto. Se encuentra en el centro del agradable barrio de "Église de Pantin".
En 1662, el abad de Richelieu y el párroco Guillaume Carrelu se comprometieron a reconstruir el coro con la condición de que los gastos de renovación de la nave fueran financiados por el pueblo de Pantin. El campanario del antiguo edificio se conservó y la primera piedra del nuevo edificio se colocó en 1664.
Durante los siglos siguientes, la iglesia se renovó constantemente. En 1737-1738, la nave se cubrió con una bóveda de cañón mientras Joachim Beausire reconstruía la torre cuadrada del sur, aún visible hoy en día. En 1826, se pidió a un hombre llamado Villedoc que "añadiera elegancia" a la iglesia. Acometió obras de consolidación y añadió un porche rematado por un frontón triangular.
En el siglo XX, la iglesia corría peligro de derrumbarse porque la inestabilidad del subsuelo ponía en peligro los cimientos. Saint-Germain-l'Auxerrois se salvó in extremis de la destrucción, decidida en 1976, gracias a su clasificación como monumento histórico en 1978.
La restauración de la iglesia de Pantin se decidió en 2013. Las obras de la iglesia de Saint-Germain comenzaron en junio de 2020 y está previsto que finalicen en febrero de 2023. La inauguración y apertura al público está prevista para el 15 de abril de 2023. Las obras incluyen :
En cuanto a la restauración de 2023, los arquitectos, monumentos nacionales, se basaron en los distintos archivos y en una foto de la iglesia tal y como quedó después de las obras de Villedoc. Se añadieron dos "ollas de fuego" al frontón, "aditamentos" que se encontraron durante las obras, también eran visibles en la foto de referencia.
Los decoradores aplicaron un encalado "ocre dorado" al exterior y al interior de la iglesia; se comprobó que éste era su color original en 1664 y el procedimiento de la época. El encalado está hecho de agua, cal pura y tierra natural, es transpirable (evacua la humedad). La base coloreada es un encalado rojo que había originalmente. La puerta de la iglesia data del siglo XVII.
Se han reintroducido las vidrieras de Jacques Le Chevallier: la vidriera "abstracta" de los años 50 está instalada cerca de la pila bautismal de mármol rojo del siglo XVIII (esta vidriera estuvo guardada durante varias décadas en una caja). Las vidrieras del lado "calle" destacan por su sencillez (casi sin color) frente a las del lado "sacristía" que representan santos.
Iglesia de Pantin: traducción de salmos, blasón borrado, según los colores originalesDespués de haber retirado el cemento y el hormigón puestos en los años 70, varias sorpresas como el color de las paredes, aparición de salmos (supuesta traducción del jansenismo) en las paredes del crucero, blasones que se adivinan, los que se borraron durante la revolución, restos de baldosas en el ábside.
En la actualidad, el tejado de la iglesia está cubierto de tejas y el campanario, de pizarra.
En el ático, antiguamente tapiado, se encontraron varias pinturas enrolladas. En el campanario hay pintadas de época.
La iglesia cuenta con un óleo sobre tabla del siglo XVII que representa a Cristo y a Santa Magdalena lavando y perfumando sus pies durante una comida en casa de Simón el Fariseo. Este cuadro se atribuye a Franck le Vieux, fallecido en 1616.
La pila bautismal de Saint-Germain-l'Auxerrois es de mármol. La cuba roja contrasta con el gris del pie, resaltando la simplicidad de las formas. Desde la renovación del edificio, la pila bautismal descansa sobre una base moderna.
Por último, un tapiz, realizado en 1959 por Plasse Le Gisne a partir de un dibujo de Léon Zack, representa una crucifixión. En un estilo esquemático cercano a la abstracción, este tapiz está realizado en una gama cromática de tonos que lo convierte en una obra contemporánea que no es realmente narrativa sin dejar de ser explícita.